Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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