Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms