Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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