Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Timm44O35857 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timm44O35857 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Timm44O35857 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Timm44O35857 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Timm44O35857 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Timm44O35857 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Timm44O35857 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms