Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clk2O35491 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk2O35491 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk2O35491 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk2O35491 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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