Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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