Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6aO35464 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms