Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms