Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms