Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms