Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Casq1O09165 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casq1O09165 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casq1O09165 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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