Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms