Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms