Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MttpO08601 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MttpO08601 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MttpO08601 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MttpO08601 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MttpO08601 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MttpO08601 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MttpO08601 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MttpO08601 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MttpO08601 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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MttpO08601 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MttpO08601 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MttpO08601 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MttpO08601 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MttpO08601 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MttpO08601 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MttpO08601 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MttpO08601 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MttpO08601 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MttpO08601 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MttpO08601 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MttpO08601 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MttpO08601 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MttpO08601 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MttpO08601 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MttpO08601 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MttpO08601 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MttpO08601 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MttpO08601 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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MttpO08601 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MttpO08601 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MttpO08601 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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MttpO08601 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms