Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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