Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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