Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2035J3QP87 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms