Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm21900J3QP38 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gm21900J3QP38 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gm21900J3QP38 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gm21900J3QP38 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm21900J3QP38 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm21900J3QP38 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm21900J3QP38 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm21900J3QP38 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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