Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms