Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms