Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms