Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r34G3XA52 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r34G3XA52 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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