Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Vmn1r167G3UW71 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Vmn1r167G3UW71 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Vmn1r167G3UW71 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Vmn1r167G3UW71 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Vmn1r167G3UW71 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Vmn1r167G3UW71 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Vmn1r167G3UW71 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Vmn1r167G3UW71 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Vmn1r167G3UW71 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r167G3UW71 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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