Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl26F8VQM2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms