Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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