Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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H2-M1F7CXU4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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H2-M1F7CXU4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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H2-M1F7CXU4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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H2-M1F7CXU4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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