Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms