Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms