Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Crocc2F6XLV1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms