Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20671F6TVX7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms