Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf212F6TQD1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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