Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmod3E9QA62 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms