Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd7E9Q9W7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms