Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P5

Gm3127, Predicted gene 3127, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3127E9Q9P5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gm3127E9Q9P5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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Gm3127E9Q9P5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Gm3127E9Q9P5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3127E9Q9P5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms