Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

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Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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TrdnE9Q9K5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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TrdnE9Q9K5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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TrdnE9Q9K5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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TrdnE9Q9K5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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TrdnE9Q9K5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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TrdnE9Q9K5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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TrdnE9Q9K5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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TrdnE9Q9K5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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