Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
6030445D17RikE9Q8F9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms