Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Gm5407E9Q7Q1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
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Gm5407E9Q7Q1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Gm5407E9Q7Q1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Gm5407E9Q7Q1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Gm5407E9Q7Q1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Gm5407E9Q7Q1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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