Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
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ApobE9Q414 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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