Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CenpfE9Q3P4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CenpfE9Q3P4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms