Protein–RNA interactions for Protein: E9Q366

Speer4f2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4f2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f2E9Q366 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer4f2E9Q366 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms