Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc171E9Q1U1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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