Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm3250E9Q1M3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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