Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Zfp558E9Q1J0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Zfp558E9Q1J0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Zfp558E9Q1J0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Zfp558E9Q1J0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Zfp558E9Q1J0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Zfp558E9Q1J0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Zfp558E9Q1J0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Zfp558E9Q1J0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Zfp558E9Q1J0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Zfp558E9Q1J0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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