Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms