Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms