Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms