Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms