Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms