Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms