Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms